Blåmuslinger lever naturligt i alle danske farvande. I farvandsområder, hvor der årligt forekommer iltsvind, yder fiskerierhvervet en stor frivillig indsats for, at omplante muslingeyngel til vækst områder, udpeget som omplantningsbanker. Blåmuslinger bliver også opdrættet i vandsøjlen på opdrætsanlæg og på havbunden i udlagte kulturbanker
Fiskeri efter den Europæiske fladøsters (Ostrea Edulis) i Limfjorden er fra sæsonen 2022/23 indstillet på ubestemt tid på baggrund af biologisk rådgivning fra DTU Aqua. I 2015 blev der første gang konstateret bonamia i Limfjorden og siden er bestanden af den europæiske fladøsters gået stærkt tilbage. Bonamia er en parasit, som forsager sygdom og dødelighed for europæisk fladøsters. Parasitten er ikke farlig for mennesker.