Det er muligt at søge om tilskud selvom kommunen har meddelt påbud om sløjfning af ens brønd eller boring, idet et tilskud ikke hindrer påbuddets gennemførelse, men blot muliggør finansiering af sløjfningen. Såfremt der ikke modtages tilskud, skal påbuddet fortsat efterleves. Det er op til kommunen at vurdere, hvordan de vil håndtere håndhævelsen af et påbud.
I tilfælde hvor kommunen, almene vandforsyninger og vandsamarbejder ansøger på vegne af en eller flere private brøndejere, er det deres vurdering, om de vil administrere ansøgningen som en frit-lejde ordning, eller om kommunen skal opfølge ansøgningen med påbud til de involverede ejere, såfremt der ikke opnås tilskud.